Можно если дополнительный отпуск предоставляется за:
• вредные или опасные условия труда;
• особый характер труда;
• ненормированный рабочий день;
• работы в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях;
• в других случаях, предусмотренных ТК РФ и иными федеральными законами.
Если же отдых предоставляется по другим основаниям, например по коллективному договору, то выплаты учесть будет нельзя. В таком случае лучше работнику оформить отпуск за свой счет, а затем выплатить ему премию.