В Письме от 12 ноября 2015 года № 03-07-14/65155 Минфин разъяснил: если компания выставляла по необлагаемым НДС операциям счета-фактуры и не сообщила об освобождении, то она должна перечислить сумму налога, отраженную в документе. При этом, что делать с «входным» НДС, ведомство не уточнило.
Ранее, до выхода постановления Пленума ВАС РФ от 30 мая 2014 года № 33 в котором, по сути, выражен противоположный подход, контроллеры настаивали: налогоплательщик, который не сообщил об отказе от освобождения, не вправе принимать «входной» НДС к вычету.
Так, в Письмах от 19 сентября 2013 года № 03-07-07/38909, от 26 августа 2010 года № ШС-37-3/10064 Минфин и ФНС возражали против применения продавцом вычета в такой ситуации. Судебная практика по данному вопросу единообразием не отличается. Есть примеры, когда арбитры разделяют точку зрения фискалов. Поскольку компания не отказалась от освобождения по НДС, у общества нет права на налоговый вычет - такой вывод, в частности, можно найти в постановлении ФАС Московского округа от 28 мая 2014 года № Ф05-3528/14.
Есть примеры, когда арбитры встают на сторону организаций. Они указывают: несвоевременное представление компанией заявления об отказе от использования льготы само по себе не свидетельствует о неправомерном применении вычетов, ведь это право, а не обязанность фирмы, которое не зависит от разрешительных действий налогового органа (постановления ФАС Западно-Сибирского округа от 21.03.2014 г. по делам № А27-2557/2013, № А27-10117/2013, от 22.11.2013 г. по делу № А27-20772/2012). В такой ситуации компания вправе применять вычеты по НДС, если они выставляли счета-фактуры по льготируемым товарам (работам, услугам) и уплачивали налог в бюджет (постановление ФАС Поволжского округа от 26.10.2012 г. по делу № А55-1577/2012).
Пленум ВАС РФ в № 33 поставил точку в спорах по этому вопросу, сделав такой вывод: если при реализации товаров (работ, услуг), не облагаемых по статье 149 НК, компания выставила счет-фактуру с НДС, то «входной» налог принять к вычету можно. Аргументировал свой вывод Высший арбитражный суд так: в описываемой ситуации обязанность уплатить НДС в бюджет возлагается на организацию. А значит, она имеет полное право применить вычеты по товарам (работам, услугам), приобретенным для облагаемых операций.
Например, если фирма продала с НДС необлагаемые товары только одному покупателю (а остальным - без налога), то принять к вычету можно «входной» налог, относящийся именно к реализованной продукции.
В результате может оказаться, что и платить в бюджет ничего не придется, например, если «входной» НДС будет равен или больше налога, указанного в выставленном счете-фактуре.
После того как ВАС РФ обозначил свою позицию, компаниям стало проще отстоять в суде право на вычет «входного» налога. Фискальным органам могу посоветовать вспомнить Письмо Минфина от 7 ноября 2013 года № 03-01-13/01/47571. В нем финансовое ведомство пришло к выводу: если мнение контролирующих органов по какому-либо вопросу отличается от позиции Высшего Арбитражного Суда, то инспекторы в своей работе должны руководствоваться мнением судей, а не разъяснениями Минфина или ФНС. Так что будем надеяться, что они вспомнят про свои разъяснения и споров на эту тему больше не возникнет.